Yves Savoye-Peysson

- (1er juillet 2020) Quelques changements à partir d'aujourd'hui. A la demande de coll!ègues américains qui suivent le site, j'ai ajouté l'Arizona, la Californie et la Floride dans la liste des états suivis. Par ailleurs, dans la foulée, jai ajouté l'Inde et le Mexique, deux pays dans lesquels l'épidémie se développe activement. Il faudra quelques jours avant d'avoir la suite complète de l'évolution des paramètres, temps de calcul oblige, mais je donnerai d'ores et déjà le meilleur ajustement actuel au jour d'aujourd'hui.

- (1er juillet 2020) La pause au Brésil n'était qu'apparente. Le nombre journalier de décès est reparti nettement à la hausse comme aux Etats-Unis.

- (1er juillet 2020) Pour rappel, cette carte très intéressante, véritable tableau de bord de la COVID-19 dans le monde.

- (1er juillet 2020) Le bilan repart à la hausse aux États-Unis avec près de 1200 morts en 24h. Lire l'article ici.

- (1er juillet 2020) Dans une ville du nord de l'Italie, 40% de porteurs du coronavirus n'avaient aucun symptôme. Lire l'article ici.

- (1er juillet 2020) Alors que les autorités luttent contre le scepticisme vis-à-vis des vaccins, le Pr. A. Fauci avertit que les États-Unis pourraient toucher 100 000 cas par jour. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

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- (2 juillet 2020) Le feuilleton de l'année. L'AP-HP accuse le professeur Didier Raoult de faux témoignage lors de son audition à l'Assemblée. Lire l'article ici.

- (2 juillet 2020) Leicester, Melbourne, Lisbonne... Ces zones reconfinées par peur d'une deuxième vague de Covid-19. Lire l'article ici.

- (2 juillet 2020) Covid: Plus de 160.000 cas par jour dans le monde depuis une semaine. Lire l'article ici.

- (2 juillet 2020) 18 nouveaux morts dans les hôpitaux français en 24 heures par le coronavirus. Une analyse plus détaillée est aussi fournie. Lire l'article ici.

- (2 juillet 2020) Coronavirus: la confiance dans les autorités suédoises en nette baisse. Lire l'article ici.

- (2 juillet 2020) Qu'est-ce que la MIS-C, la maladie rare liée au Covid-19 qui touche gravement des enfants ? Lire l'article ici.

- (2 juillet 2020) Coronavirus aux Etats-Unis: l'épidémie s'accélère, plusieurs Etats renforcent leurs restrictions. Lire l'article ici.

- (2 juillet 2020) Autopsies de coronavirus: une histoire de 38 cerveaux, 87 poumons et 42 cœurs. On apprend qu'il y a pas mal de similitudes entre les dégâts causés par la dengue et le SARS-CoV-2. Mais le reste de l'analyse est vraiment passionnant. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (2 juillet 2020) La charge virale joue un rôle important dans la gravité de la maladie. Lire ici, ici et ici des articles sur le sujet. Merci pour les liens !

- (2 juillet 2020) En terme de nombre quotidien de décès, l'Iran a dépassé les pires heures du début de l'épidémie en février. Cela montre une chose : tout peut repartir très vite et aussi fort qu'au début, ce qui n'est pas étonnant vu la faible proportion de gens immunisés. Donc s'il y a relachement, on peut vraiment être confronté à une seconde vague. D'ailleurs, à ce propos, quelle définition peut-on donner à une seconde vague ? Pour moi, ayant pris les décès comme proxy le plus fiable, c'est la présence d'un minimum dans la courbe du nombre quotidien de décès. Cela prouve sans équivoque que l'épidémie est bien repartie, et qu'il ne s'agit pas d'un effet de comptage. Maintenant, existe-t-il des signes avant-coureur ? Au regard de ce qui s'est passé en Iran, la remontée des cas certifiés peut être brutale (voir figure) et sans signe préalable particulier. Cependant, en regardant ce qui se passe en Suède et aux Etats-Unis, la présence d'un plateau de cas certifiés qui ne faiblit pas pendant des semaines semble être un signe annonciateur d'une possible reprise, qui doit être confirmée par la reprise des décès. Tant que les décès ne repartent pas à la hausse, on ne peut considérer que l'explosion des cas certifiés relève d'une réelle seconde vague. Sur la base de ce critère, seul l'Iran fait face à une seconde vague. D'ailleurs le R0 sur une moyenne glissante de 5 jours tend à remonter. C'est un indicateur qui doit alerter. Le R0 peut remonter avec le bruit, mais la différence dans la dynamique est très visible. D'autres pays ou états comme l'Arizona, la Floride ou les Etats-Unis pris globalement et la Suède font face à une reprise des cas, mais pas encore une réelle seconde vague. Ce qui n'empêche pas que la situation soit inquiétante. Quant au Brésil, Mexique ou l'Inde, ces pays sont dans la première vague, une vague qui n'en finit pas... car les règles de distanciation sociale sont faibles ou inexistantes, avec une susceptibilité à la maladie très grande liée à l'existence de villes de très grande taille et surtout très denses. La relative jeunesse de la population pour ces trois pays les sauvent d'un gouffre complet. Par exemple,le risque épidémique comme défini dans la section concernée (analyse globale) est de 0.0025329 pour le Brésil, et 0.0047608 pour l'Italie. Si on effectue le rapport de ces nombres, sans réel confinement, et si la population du Brésil avait la même pyramide des âges que l'Italie, ils devraient avoir deux fois plus de décès. Mais c'est une évaluation grossière, juste un ordre de grandeur. Avec un risque de 0.0019908 pour l'Inde, ce grand pays limite encore plus la casse malgré tout.

- (2 juillet 2020) Pour comparer les dynamiques de la COVID-19, les nombres journaliers de décès ont été normalisés à la valeur maximale atteinte, et toutes les courbes ont été repositionnées par rapport au jour où le maximum est atteint. Les jours négatifs correspondent ainsi à la phase ascendente de l'épidémie, et les jours positifs à la phase descendante. Le diagramme ci-dessous est particulièrement instructif. D'abord, dans la phase ascendente initiale, tous lespays présentent une dynamique très voisine. Le fameux R0 vient de là, et il est proche de 3. Ensuite, à l'approche du pic, il y a certains pays pour lesquels le développement de l'épidémie a toujours été très rapide et d'autres non. Par ordre décroissant : l'Espagne, la Chine et la Belgique. Vient ensuite un groupe important qui ont des dynamiques très proches : France, Italie, Royaume-Uni, Etats-Unis, Pays-Bas, Allemagne, la Suisse et enfin deux pays se distinguent pour la lenteur du développement de l'épidémie, la Suède surtout et dans une moindre mesure le Québec. Une fois le pic épidémique passé, la décroissance présente des différences notoires. La décroissance la plus rapide est la Chine, mais on trouve avec la même temporalité la Suisse et la Belgique. La Suisse n'a a priori pas imposé un confinement strict comme la Chine et la Belgique, mais pour avoir cette dynamique identique, on peut imaginer que les citoyens suisses ont été extrêmement prudents. Vient ensuite un paquet de pays dans lequel on trouve la France, l'Italie et l'Espagne, qui ont appliqué un strict confinement, mais aussi l'Allemagne et les Pays-Bas, qui font mieux sans confinement strict !!! Enfin un dernier groupe rassemble les Etats-Unis, le Québec, la Suède, et dans une moindre mesure le Royaume-Uni, qui ont une décroissance très faible. On notera l'analogie que j'avais soulignée entre les Etats-Unis et la Suède. La Royaume-Uni fait pire que ses voisins européens, Suède mise à part, mais un peu mieux que les Etats-Unis. Maintenant, que déduire de toute cela ? Le confinement a-t-il été utile ? Il est difficile de tirer des conclusions fortes, mais de toute évidence, quand les règles de distanciation sociale sont bien appliquées (confinement imposé ou non), la décroissance est rapide. Moins les règles sont respectées, plus la décroissance est lente. Les cas singuliers, comme la Suisse mérite une attention particulière, car si ce pays m'a pas mieux géré la phase ascendante, il a en revanche bien géré la phase post-pic. Je sais par quelques amis suisses que les personnes âgées ont été rapidement isolées des plus jeunes, dans les familles notamment. Est-ce la clé du succès, un confinement différentiel qui ne dit pas son nom ? C'est possible et cela rejoint l'analyse évidente que j'ai faite sur l'impact d'un confinement des personnes de plus de 65 anas (voir plus bas). Au vu de ces résultats, j'aurai tendance à croire que le civisme de la population est une des clé du succès pour combattre l'épidémie. Le confinement a certainement une utilité pour marquer les esprits et forcer les gens à être attentifs. Il y aura certainement beaucoup à discuter de cette comparaison...

- (3 juillet 2020) Le feuilleton de l'année, mieux que Plus Belle la Vie !!! Didier Raoult accusé de propos "infamants" et de "calomnie" par le Conseil scientifique et la HAS. Lire les articles ici et ici .

- (3 juillet 2020) Le virus SARS-CoV-2 a-t-il muté et est-il plus contagieux ? Lire l'article ici.

- (3 juillet 2020) Situation générale de la COVID-19:

• Allemagne : depuis 20 jours, le nombre de cas certifiés ne baisse plus, et reste sur 300-400 quotidiens. Le nombre de décès baisse, mais la décroissance est moins rapide qu'avant.
• Arizona (USA) : Explosition du nombre de cas certifiés. Le nombre journalier de décès commence à monter, critère d'une seconde vague.
• Belgique : Tendance inchangée. Très nette inflexion de la décroissance depuis le déconfinement, cas et décès. La pente décroissante semble rester encore régulière malgré tout
• Brésil : L'épidémie ne faiblit pas, mais le nombre quotidien de décès se stabilise autour de 1200-1300. Cela devrait durer ainsi longtemps, et finalement le code prévoit plus de 220,000 décès.
• Californie (USA) : Croissance régulière du nombre de cas certifiés et du nombre journalier de décès. L'état est toujours sur la 1ère vague, mais aucun signe d'une stabilisation.
• Chine : la situation est revenue sous contrôle, depuis le cluster de Pékin. Le nombre de cas certifiés est retombé. Pas de décès lié à la COVID-19 depuis 30 jours environ. Une alerte, mais des centaines de milliers de personnes sont en confinement strict actuellement.
• Corée du Sud : toujours beaucoup de cas certifiés depuis presque un mois. Celui-ci n'est pas à la baisse, ce qui démontre la difficulté à juguler cette épidémie. Le nombre de décès reste toujours très faible.
• Espagne : Le nombre journalier de décès reste faible et fluctuant, mais proche des prédictions du modèle. Quand au nombre de cas certifiés, on observe également un plateau vers 300 nouveaux cas par jour depuis 20 jours. Il ne faiblit pas.
• Etats-Unis : remontée confirmée de nouveaux cas certifiés, 50,000 par jour environ, et qui ne semble pas faiblir. Difficile d'évaluer l'impact sur les décès à ce stade.
• Floride (USA) : Une explosition sans précédent du nombre de cas certifiés. Le nombre journalier de décès commence à monter, critère d'une seconde vague en train d'arriver.
• Fortaleza (Brésil) : Situaton chaotique, énormément de fluctuations d'un jour à l'autre pour les décès et nouveaux cas certifiés. Mais la tendance reste inchangée, la ville est sur le pic épidémiqe. La précision des calculs est intrinsèquement mauvaise.
• France : Le nombre journalier de nouveaux cas de contamination augmente clairement et atteint 700 par jour environ (effet du comptage ou réalité, toujours pas clair). Le nombre de décès baisse régulièrement, en accord avec la tendance dégagée depuis de nombreuses semaines. C'est un bon point.
• Inde : L'épidémie ne faiblit pas, et le nombre quotidien de décès augmente régulièrement pour atteindre désormais 500 en moyenne. Ce n'est pas encore la situation au Brésil, mais le pays y vient jour après jour. Les projections sont évidemment catastrophiques, de l'ordre de 1,368,000 décès alors que la population est assez jeune. L'effet des villes immenses et très denses...
• Iran : Seconde vague épidémique sans équivoque. Actuellement, environ 140 décès quotidiens, situation pire qu'en Février. Une mauvaise gestion de l'épidémie ou un comportement irresponsable des iraniens vis-à-vis du virus. Le nombre de cas certifiés semblent se stabiliser.
• Italie : Decroissance régulière des décès, et aussi des cas quotidiens de contamination, même si on observe un ralentissement depuis plusieurs jours.
• Liban : Toujours de nombreux cas quotidiens de contamination, qui fluctuent énormément d'un jour à l'autre, autour de 15 environ. C'est peu mais cela ne baisse pas. Les décès restent à un niveau très bas depuis des semaines. L'épidémie n'est pas sous contrôle.
• Mexique : La dynamique de la COVID-19 au Mexique est très voisine de celle au Brésil. Perspectives très sombre en terme de mortalité cumulée, autour de 178,000 décès. C'est moindre qu'au Brésil, mais la population est deux fois plus petite.
• Pays-bas : Très long plateau de cas de contaminations autour de 300 environ, qui se termine lentement, depuis trente jours. le nombre de nouveaux décès baisse régulièrement, et atteint la limite de un par jour.
• Pologne : Situation comme aux Etats-Unis. Long plateau des cas quotidiens de contamination, autour de 300-400 par jour qui ne faiblit pas. On observe également un palier dans le nombre de décès quotidiens, ce qui corrobore la dynamique générale de l'épidémie qui n'est pas contrôlée.
• Québec (Canada) : Baisse artificielle du nombre de cas de contamination (changement de méthode de comptage pour ne pas effrayer la population, dixit), après un long plateau. Le nombre de décès baisse régulièrement, en accord avec la tendance dégagée depuis plusieurs semaines.
• Royaume-Uni : Baisse du nombre de nouveaux cas quotidiens de contamination et de nouveaux décès. Pas de platau pour les nouveaux cas de contamination.
• Suède : Net redémarrage de l'épidémie. Le nombre de nouveaux cas de contamination est toujours de l'ordre de 1,500 par jour ce qui est sérieux pour ce petit pays de 10 millions d'habitants. Difficile de dégager une tendance nette pour les décès, qui semblent également sur un plateau, mais les données sont très fluctuantes.
• Suisse : Les décès sont au plancher, mais le nombre de nouveaux cas de contamination repart fortement à la hausse et atteint désormais 140 par jour. Remontée aussi rapide qu'en ... Floride alors que le pays avait géré de manière exemplaire l'épidémie. Cela démontre la fragilité de la situation.

- (3 juillet 2020) Un truc vachement sympa ! Il fallait y penser... Bon weekend covid ! Lire l'article ici.

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- (4 juillet 2020) Difficultés pour obtenir les données de Fortaleza ! Le site a encore changé.

- (4 juillet 2020) L'infectiologue Karine Lacombe renonce à se rendre en Guyane pour son essai controversé sur le coronavirus. Lire l'article ici.

- (4 juillet 2020) Va-t-on injecter le virus aux volontaires qui testent les vaccins? Lire l'article ici.

- (4 juillet 2020) Rocco Siffredi va être jaloux :) !!! Lire l'article ici.

- (4 juillet 2020) La Catalogne reconfine 200,000 personnes. Lire l'article ici.

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- (5 juillet 2020) La Catalogne et l'Australie reconfinent, record aux Etats-Unis... Le point sur la pandémie. Lire l'article ici.

- (5 juillet 2020) Sanofi : déception sur un potentiel médicament contre le coronavirus. Lire l'article ici.

- (5 juillet 2020) 239 experts avec 1 grande réclamation: le coronavirus est aéroporté. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (5 juillet 2020) Après la Catalogne, une autre région confine 70.000 personnes. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (5 juillet 2020) Lyon: Le coronavirus frappe l’un des nouveaux conseillers municipaux, tous les élus EELV vont être testés. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

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- (6 juillet 2020) Seulement 1,3 % des habitants testés ont développé des anticorps.Voilà un résultat intéssant et étonnant. Cela voudrait donc dire que le taux de lélatilité est plus important que 0.7%, mais plutôt de l'ordre de 3%. A voir à l'usage. Lire l'article ici.

- (6 juillet 2020) Comment la 5G a accompagné la lutte contre le coronavirus en Chine. Lire l'article ici.

- (6 juillet 2020) Pandémies et forme de l'histoire humaine. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

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- (7 juillet 2020) Ls Pays-Bas abattent des milliers de visons à cause de la COVID-19. Triste effet collatéral. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (7 juillet 2020) Des singes infectés par le coronavirus ont développé une immunité à court terme. Lire l'article ici.

- (7 juillet 2020) Un algorithme peut-il prédire les prochains évolutions de la pandémie? Très intéressant. A voir a posteriori ! Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (7 juillet 2020) Une suite de preprints (article soumis à publication mais non encore validé, donc à lire avec des réserves) plutôt pessimistes sur pleins de sujets : étude indienne sur l'influence de la température et l'humidite sur le facteur R0, efficacité du traitement par transfert de plasma sanguin, l'immunité croisée, la détermination statistique du facteur R0.. Bilan globalement bien sombre. Merci pour les liens !

- (7 juillet 2020) C'est officiel, le président J. Bolsonaro est attient de la COVID-19. L'arroseur arrosé ! Le problème, ce sont les milliers de vies en jeu. Lire l'article ici.

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- (8 juillet 2020) Les vacances commencent mal pour quelques lyonnais. Il vaut mieux qu'elles finissent bien ! Lire l'article ici.

- (8 juillet 2020) En France, l'impressionnante surmortalité des personnes nées à l'étranger. Un sujet très important qui nécessaitera certainement des études nombreuses et approfondies. Beaucoup d'enseignements à tirer, et pas seulement pour la COVID-19. Lire l'article ici.

- (8 juillet 2020) 26 % de décès supplémentaires entre début mars et mi-avril 2020 : les communes denses sont les plus touchées. C'est ce que j'avais annoncé déjà mi-avril avec calculs à l'appui, et ce n'était pas une surprise ni une spécificité de la COVID-19 ! Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (8 juillet 2020) Une étude espagnole sur les anticorps montre que 5% de la population a été exposée au coronavirus. Selon les calculs, avec une létalité de 0.7%, on aurait 10% de la population qui aurait été en contact avec le virus, et si cette létalité est prise à 2.5%, seuls 3.5% de la population aurait été infectée pour reproduire dans les deux cas la dynamique observée des décès (voir les courbes de simulations). Toute la question est en fait quand l'étude a été menée : du 27 avril (lendemain du déconfinement) au 11 mai. En reprenant les courbes pendant cette période, on constate que les chiffres ont peu évolué, de l'ordre de 10% pour 0.7% de létalité. Pour retrouver 5%, il faudrait prendre une létalité de 1.4% ce qui est assez élevé. A suivre donc ! Lire l'article de presse ici et la publication ici. Merci pour le lien !

- (8 juillet 2020) COVID-19: une infection sur deux se produit avant l’apparition des symptômes. Lire l'article ici.

- (8 juillet 2020) L'impact de la COVID-19 sur l'activité économique internationale. Très instructif sur le monde ... d'Après !! Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (8 juillet 2020) L'impact de la COVID-19 sur l'activité économique française. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

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- (9 juillet 2020) Salomon appelle à se préparer à une "deuxième vague" et à ne "pas relâcher les efforts". Lire l'article ici.

- (9 juillet 2020) Hallucinations, AVC, délire… Des problèmes cérébraux possibles, même dans des formes bénignes. Lire l'article ici.

- (9 juillet 2020) La courbe épidémique des cas confirmés est très à la hausse aux Etats-Unis, et on commence à voir des signes sur les décès.

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- (10 juillet 2020) Une enquête minutieuse qui montre de manière époustouflante la contagiosité du SARS-CoV-2. Lire l'article ici.

- (10 juillet 2020) Pas même un moustique n'aurait pu sortir du laboratoire P4 de Wuhan en Chine ! Lire l'article ici.

- (10 juillet 2020) Coronavirus: que se passe-t-il en Mayenne, où les cas se multiplient? Lire l'article ici.

- (10 juillet 2020) Gare au relachement des gestes barrières. Le risque de seconde vague pourrait gacher l'été... Lire l'article ici.

- (10 juillet 2020) Recrudescence de cas de COVID-19 en Algérie. Lire l'article ici.

- (10 juillet 2020) Pas très rassurant: la transmission intra-utérine mère-enfant est maintenant avérée. Lire l'article ici.

- (10 juillet 2020) Le retour de traces de génome du SARS-CoV-2 dans les eaux usées de Paris est un indicateur précoce d'une reprise des contaminations. A suivre. Lire l'article ici.

- (10 juillet 2020) Une étude sur 17 millions de personnes identifie des facteurs de risque cruciaux pour les décès par coronavirus. Très intéressant. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (10 juillet 2020) Le R0 augmente aujourd'hui dans les trois états américains que je suis depuis quelques jours : Floride, Arizona, Californie. Ainsi qu'en Iran. Cela signifie que pour ce trois états et ce pays, le nombre de décès est en augmentation, puisque le proxy pour les calculs est le nombre journalier de décès. Comme les décès arrivent après les cas de contamination (environ une douzaine de jours), c'est bien le signe que, comme pour l'Iran, il ne s'agit pas d'un effet du nombre de tests, mais d'une reprise marquée de l'épidémie, une seconde vague comme je l'ai définie. Les prochains jours seront très instructifs. A noter que le nombre quotidien de décès au Brésil semble saturer autour de 1250 par jours. Il y a quelques semaines, le code prédisait bien cette saturation, plutôt vers 1400, et ce nombre a légèrement baissé, mais la dynamique observée est bien celle qui avait été prédite. J'avais donc annoncé que le Brésil devrait atteindre 100,000 décès vers le 25 juillet, et compte-tenu de la baisse des décès journaliers, on atteindra ce chiffre symbolique début août. Mais à quelques jours près, ce qui est inévitable vu les fluctuations des données, le code a fait des prédictions très correctes. Hélas...

- (10 juillet 2020) La France est prête pour le seconde vague dixit le ministre de la santé ! On vérifiera cela à l'usage... Lire l'article ici.

- (10 juillet 2020) La pandémie s'accélère sur le continent américain, et certains gouvernants sont contaminés ! Lire l'article ici.

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- (11 juillet 2020) Inflammation, état délirant : le Covid-19 semble lié à des dommages cérébraux sévères. Lire l'article ici.

- (11 juillet 2020) "Non, les Etats-Unis ne s'en sortent pas bien avec le virus": Anthony Fauci, expert du Covid-19, enfonce le gouvernement américain. Lire l'article ici.

- (11 juillet 2020) Pour Santé Publique France, "la circulation du virus tend à progresser" dans le pays. Lire l'article ici.

- (11 juillet 2020) Plus de 4 millions d'habitants de France métropolitaine déjà infectés. Cela représente 6.7% de la population française, et le code prédit 6.5% avec le taux de létalité le plus probable, 0.7%, déterminé à partir du Diamond-Princess ou du Shackleton. Un joli résultat qui souligne la pertinence de l'approche ! Lire l'article ici.

- (11 juillet 2020) Les Français ne se font pas assez tester, à qui la faute ? Lire l'article ici.

- (11 juillet 2020) Vaccin contre le Covid-19: où en est la recherche? Lire l'article ici.

- (11 juillet 2020) Coronavirus: la France passe la barre des 30.000 morts. Cela faiait longtemps que l'onsavait avec le code que ce chiffre allait être atteint... Depuis plus de 40 jours, au moins ! Lire l'article ici.

- (11 juillet 2020) Bilan des simulations : on voit nettement repartir les décès pour la Floride, la Californie et les Etats-Unis, ainsi que l'Iran, donc le RO que je calcule sur cette base augmente (même après moyenne glissante sur 5 jours). C'est signe que la situation se dégrade et évolue dans le temps défavorablement. Ce n'est pas une surprise. Trump a tort quand il prend pour prétexte le nombre de tests. Celui-ci n'augmente plus, mais le nombre de cas positifs si ! On constate un peu partout une reprise des cas, plus ou moins forte selon les pays en Europe. La Chine a jugulé la crise à Beijing, mais la Corée du Sud ne s'en sort pas. Quant au trio Brésil, Mexique, Inde, c'est toujours dramatique. Au Brésil, le nombre de décès par jour plafonne à 1200 environ. Au Mexique il augmente et va bientôt atteindre 1000 ! La situation est moins grave en Inde, même si le nombre de personnes concernées est plus élevé, vu la taille de la population. Epargnée partiellement par la pyramide des âges.

- (11 juillet 2020) IMPORTANT : nette stabilisation du nombre de décès en France qui baissait régulièrement et maintenant ne descend plus ! Cela arrive environ deux semaines après la stabilisation puis l'augmentation progressive du nombre d'infections, comme pour d'autres pays (la Suisse, la Suède, ...) . Cela ne change pas encore le R0, car le nombre de décès en jeu reste faible (25-35), mais si celui-ci augmente franchement et durablement, on pourra alors parler de l'arrivée d'une seconde vague selon les critères définis quelques jours auparavant ! A noter que le nombre actuel de décès journalier est 5 fois supérieur à la dynamique observée pendant 8 semaines !! On devrait avoir 5-7 décès par jour et c'est loin d'être le cas puisqu'on tourne autour de 25 à 35 selon les jours. La situation est donc très sérieuse, même si les médias restent discrets sur la question du nombre quotidien de décès. Il faut appliquer les gestes de distanciation sociale, sinon des confinements locaux plus ou moins importants seront inévitables pour éviter un emballemnt de la situation. Cela gâcherait les vacances... Je donne à titre comparatif la situaton en Floride et en Iran.

- (12 juillet 2020) C'est le week-end du 14 juillet et la COVID-19 ne contamine plus en France pendant 4 jours ! Donc plus de statistiques. Les pays du monde entier suivent cela au quotidien, mais on a les RTT !!... Bon week-end à tous !

- (12 juillet 2020) Vacances d’été : voici le plan de reconfinement du gouvernement. Lire l'article ici.

- (12 juillet 2020) « La tentation est grande et compréhensible d'oublier le virus, de profiter de l'été », alertent des médecins. Lire l'article ici.

- (12 juillet 2020) Une lueur d'espoir ? On peut l'espérer, mais cela semble du beau travail. Lire l'article ici.

- (12 juillet 2020) Les résultats de recherche Google révèlent les foyers de Covid-19 plus rapidement que les statistiques officielles. Impossible de faire cela en France. Lire l'article ici.

- (12 juillet 2020) Coronavirus : ce que les scientifiques ont appris sur l'immunité et ce qu'ils cherchent toujours à comprendre. Lire l'article ici.

- (12 juillet 2020) Nice: inquiétudes après un concert du DJ The Avener organisé avec 5000 personnes. On verra l'impact dans les prochains jours ! Ce fut le cas pour le rassemblement organisé par Trump... Lire l'article ici.

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- (13 juillet 2020) Toujours aucune nouvelle donnée concernant la France. Il faudra certainement attendre mercredi soir.

- (13 juillet 2020) A 30 ans, il décède du coronavirus après avoir participé à une «soirée Covid». L'exemple même de la bêtise la plus pure... C'est cher payé. Lire l'article ici.

- (13 juillet 2020) Un vaccin 100 % efficace en 2021 ? « Peu probable », estime un épidémiologiste. Lire l'article ici.

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- (14 juillet 2020) Alors que je rentrais de Lyon, un ancien collègue m'envoie un lien explosif d'un article de France-Soir ! L'hydroxychloroquine + azythromycine, ça marche, c'est irréfutable !! Incroyable, et c'est prouvé par A+B, en Suisse, le pays de la rigueur légendaire. Sous le choc, je regarde avec attention les résultats, et effectivement, je constate un surcroit de décès dans une période allant du 8 juin au 23 juin, soit, avec douze jours de décalage environ par rapport à la période pendant laquelle la HXQ + AZT aurait été interdite, suite à la très controversée (puis retirée) publication dans la revue The Lancet (voir figure ci-dessous). La létalité a donc bondi en moyenne de 400% pendant cette période, passant de 2.5% à peine, à 10% environ. Bigre ! En fait, c'est le début d'une très jolie histoire ! Comme les sources sont identiques entre la publication de France-Soir et mon travail, j'effectue des calculs très proches, mais à partir de la létalité quotidienne classique comme étant le rapport entre le nombre quotiden de nouveaux décès et celui de nouveaux cas d'infection. Ce chiffre est donné quotidiennement sur le site dans les analyses statistiques pour tous les pays suivis. Initialement, je m'attends donc à observer le créneau de surlétatalité entre le 9 et le 23 juin, mais en fait, ce sont deux pics de décès espacés de 7 jours et un niveau de cas de contamination à peu près constant pendant cette période. Quid alors du créneau ? En fait, comme annoncé dans France-Soir, les données ont été lissées sur 7 jours, et dans ce cas les deux pics se transforment en créneau comme annoncé. Effet du lissage donc. Mais un truc me chiffonne, les oscillations rapides dans le créneau, que je n'observe pas avec ma méthode. Comment cela peut être possible ? France-Soir offrant la possibilité d'être contacté par les internautes à propos d'une publication, j'écris le soir même en alertant de ce souci. Le 15 juillet, réponse et échanges téléphoniques dès le matin permettent de clarifier grandement la situation et de constater que le paramètre choisi par France-Soir est différent, étant le rapport entre les nouveaux décès quotidiens et la somme des nouveaux décès quotidiens et des personnes guéries ! Je retrouve alors les résultats annoncés, tous, tant quantitativement que qualitativement (voir figure). Donc il n'y a pas de loup derrière les résultats, et c'est une très bonne nouvelle. Au passage, je fais la connaissance d'une personne très ouverte aux échanges, transparentes quant aux méthodes de calcul, hyper-pointue sur les questions de statistiques, pour tout dire quelqu'un de vraiment plaisant. Elle m'alerte alors sur le fait qu'il existe trois bases de données et non pas deux comme je le croyais pour la Suisse : celle fournie par l'Université John Hopkins (avec les deux pics cités pour les décès dans la période étudiée) que l'on peut obtenir par github, ce que je fais quotidiennement, mais aussi la base téléchargée depuis le site corona-data.ch, que j'utilise pour les personnes en soins intensifs uniquement d'habitude, et enfin, nouveau pour moi, la base de l'Office Fédéral de la Santé Publique (OFSP). Le hic dans tout cela, c'est que le nombre de décès au 14 juillet est de 1968 pour les deux premières, et 1688 pour la troisième... Où sont passés les personnes décédées ? 15% de différence, ce n'est pas négligeable ! Mais, au-delà de ce problème considérable de comptage, les bases de corona-data.ch et de l'OFSP ne présentent pas de pics de décès entre les 9 et 23 juin !!! Qui croire alors ? Pour l'instant, c'est le mystère. Une chose est certaine, même en Suisse, les bases de données ne semblent pas très fiables dans le détail. A titre indicatif, pour les personnes en soins intensifs, il est fréquent que je sois obligé de reprendre toute la série temporelle sur un mois, car tous les chiffres ont été changés brutalement. Cela ne modifie certes pas la tendance générale, mais c'est assez désagréable. L'arrière-boutique des calculs. Pour revenir à ce qui est annoncé dans France-Soir, je peux donc attester la bonne foi des auteurs, de leur rigueur méthodologique. Peut-on néamoins en conclure que l'interdiction de l'HXQ + AZT est la cause de cette sur-létalité différée ? Il n'y a pas de réponse simple pour moi. L'incertitude relative sur les données moyennées sur 7 jours est telle que la variation relative de la létalité ou du paramètre défini par France-Soir n'est peut-être pas significative. Il semble comme indiqué par France-Soir que l'on retrouve cet effet pour la France et même d'autres pays. Ce serait très intéressant de vérifier cela dans les jours qui viennent. En tous cas, l'info de France-Soir n'a rien d'une fake-news, mais relève bien au contraire d'une approche très pointue et pertinente. Bravo, il fallait le faire et en avoir l'idée ! Au-delà du résultat lui-même, cela démontre en tous cas que les échanges entre personnes effectuant des calculs sont très fructueux quand il y a de la transparence et de l'honnêteté de part et d'autre, et cela contribue à améliorer la compréhension générale de la COVID-19. Mais qui en aurait douté !!? (l'intervalle de temps étudié est compris entre les jours 107 et 120 matérilisés par deux traits de couleur mauve.)

- (14 juillet 2020) Rave parties et COVID-19 ! Super expérience live de contamination... Sérieusement, il y en a qui planent pour de bon. Lire l'article ici.

- (14 juillet 2020) Coronavirus: une nouvelle étude estime que l'immunité disparaît après quelques mois. Lire l'article ici.

- (14 juillet 2020) Pourquoi la question du masque obligatoire se pose dans les lieux clos? Lire l'article ici.

- (14 juillet 2020) Inquiétudes à Marseille, où le nombre de cas double toutes les 48h. Cela signifie un R0 supérieur à 3 ! Lire l'article ici.

- (14 juillet 2020) Espagne, Maroc, Philippines... Des reconfinements ciblés partout dans le monde. Lire l'article ici.

- (14 juillet 2020) l'OMS s'alarme car trop de pays "prennent la mauvaise direction". Lire l'article ici.

- (14 juillet 2020) Coronavirus: restaurants et cinémas de nouveau fermés dans toute la Californie. Et pourtant, ce n'est pas le pire état... Lire l'article ici.

- (14 juillet 2020) Étude de Statistique Canada: les Québécois moins enclins à porter le masque. Lire l'article ici.

- (14 juillet 2020) La Californie dépasse les 7,000 morts et reconfine de nombreux commerces. Lire l'article ici.

- (14 juillet 2020) Covid-19 et biais d'ancrage : quand notre cerveau nous empêche de prendre la mesure du risque. Lire l'article ici.

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- (15 juillet 2020) Pourquoi la question du masque obligatoire se pose dans les lieux clos? Lire l'article ici.

- (15 juillet 2020) Pourquoi attendre le 1er août pour mettre en place le port du masque obligatoire? Lire l'article ici.

- (15 juillet 2020) Macron annonce le masque obligatoire dans les lieux clos à partir du 1er août. Lire l'article ici. Les anglais s'y mettent aussi, mais à partirdu 24 juillet. Pour une fois, ilsne perdent pas de temps. D'autant qu'il reste toujours de nombreux cas chez eux. Cliquez ici pour plus de détails.

- (15 juillet 2020) Cette info avait déjà été annoncée, mais les choses se précisent sur la contamination intra-utérine. Lire l'article ici.

- (15 juillet 2020) L'impact du SARS-CoV-2 sur les vaisseaux sanguins semble être le problème central de la COVID-19. Lire l'article très pédagogique sur le sujet en cliquant ici.

- (15 juillet 2020) Les données françaises sont toujours très partielles pour le 14 juillet, donc les simulations sont à prendre avec des pincettes...

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- (16 juillet 2020) Le COVID-19, maladie à double détente. Lire l'article ici.

- (16 juillet 2020) COVID-19 : pourquoi zéro mort au Vietnam ?. Lire l'article ici.

- (16 juillet 2020) COVID-19: reconfinements et masques obligatoires progressent dans le monde. Lire l'article ici.

- (16 juillet 2020) Le vaccin de Moderna entrera dans la dernière phase de son essai clinique le 27 juillet . Lire l'article ici.

- (16 juillet 2020) Caracas et l'Etat de Miranda placés en confinement strict au Venezuela. Lire l'article ici.

- (16 juillet 2020) Coronavirus : Nouveaux cas de Covid-19, le seuil d’alerte dépassé en Mayenne. Lire l'article ici.

- (16 juillet 2020) Quels sont les « lieux publics clos » où les masques risquent de devenir obligatoires ? Lire l'article ici.

- (16 juillet 2020) Coronavirus à Marseille : « Coup de com' » ou « sonnette d’alarme » avec le « doublement de nouveaux cas » ? Lire l'article ici.

- (16 juillet 2020) Des décennies de recherche sur un vaccin contre le VIH renforcent la demande d'un vaccin contre le coronavirus. Lire l'article ici. Merci pour l'article !

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- (17 juillet 2020) Les "Covid-parties" aux Etats-Unis, véritable phénomène ou légende urbaine? Lire l'article ici.

- (17 juillet 2020) Coronavirus: Nouvelle-Aquitaine, Mayenne, Marseille... Ces zones qui inquiètent les autorités sanitaires. Lire l'article ici.

- (17 juillet 2020) Les espions se font la chasse pour le vaccin de la COVID-19... Au secours James, ils sont devenus fous !! Lire l'article ici.

- (17 juillet 2020) Une vraie question de fond pour que la population adhère à l'usage du masque. Le nombre de clowns à roulettes qui clament sur les réseaux sociaux que le masque ne sert à rien est consternant. Lire l'article ici.

- (17 juillet 2020) Le Nord de la France est de nouveau très touché. C'est que l'on trouve le plus grand nombre de clusters. Lire l'article ici.

- (17 juillet 2020) Le masque obligatoire en France pour les lieux fermés: c'est pour très bientôt. Lire l'article ici.

- (17 juillet 2020) L'épidémie repart à la hausse en Bretagne. Lire l'article ici.

- (17 juillet 2020) Tour d'horizon international de la COVID-19. Lire l'article ici.

- (17 juillet 2020) La dernière ligne droite pour le vaccin de la startup Moderna. Croisons les doigts pour que cela marche, car la méthode de l'ARN messager n'a jamais été un succès... Lire l'article ici.

- (17 juillet 2020) Le risque de Covid-19 ne dépend pas (beaucoup) du type de sang, selon de nouvelles études. Dommage... Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (17 juillet 2020) Les inconvénients du masque !! Bonne journée à tous !

- (17 juillet 2020) Un autre vaccin prometteur développé à l'Université d'Oxford en Grande-Bretagne. Lire l'article ici. Les russes leur côté poursuivent leurs recherches sur un vaccin à très grande vitesse aussi. Lire l'article en cliquant ici.

- (17 juillet 2020) Le 14 juillet dernier, j'avais un échange avec l'équipe de France-Soir qui avait sorti un article sur la "preuve irréfutable" que le couple hydroxychloroquine + Azythromycine "marchait" en Suisse et peut-être dans d'autres pays, en d'autres termes réduisait la létalité. En fait, il s'agissait de la peuve par l'inverse, sans HXQ+AZT, les décès augmentent. Au-delà de ce résultat que je discute le 14/07 (voir plus haut), ce fut l'occasion de découvrir de multiples problèmes de cohérence dans les données suisses. Hier, j'ai été contacté par Thibault, qui a eu la gentillesse d'apporter de l'eau très utile au moulin de ce problème, en me transmettant un lien qui explique la raison du pic de décès du 9 juin, qui est bien visible sur la figure ci-dessous (base JHU). On imagine volontiers que la raison est la même pour le pic du 15 juin. Thibault m'a transmis également un autre lien tiré du compte Twitter de l'OFSP (Office Fédéral de la Santé Publique Suisse), permettant de comprendre la répartition temporelle des 12 morts annoncés le 9 juin. Sur le graphique de droite de ce tweet, on voit en orange quand sont survenues ces 12 morts, et une seul décès est arrivé en juin (il faut zoomer pour voir les zones orange) ! Comme je l'indique pour les personnes en soins intensifs obtenus depuis l'autre base corona-data.ch, les problèmes des reports de données sont courant, et reflètent la difficulté de collecte et de centralisation. Ce n'est pas propre à la Suisse. Cela concerne aussi Worldometers/JHU pour certains pays (au passage il semblerait que Worldometer soit la source de JHU pour les pays concernés... bizarre !). La France, par exemple, enregistre un nombre de décès négatifs le 19 mai (-217 décès), ce qui tend à montrer que les dates des morts sont mal reportées. La périodicité selon le jour de la semaine est également très instructive sur le report des chiffres par l'administration et là, chacun, depuis ce site, peut en prendre conscience avec la courbe de corrélation croisée que je calcule quotidiennement. Pour certains pays, c'est une courbe en cloche (Italie), forme normale, et pour d'autres comme la Suède, c'est une courbe oscillante. Evidemment, faire des simulations dans les conditions de la Suède est bien plus difficile, car les données sont entachées d'une erreur "administrative" de diffusion, et sans surprise, le R2 entre modèle et données observées est bien moins bon. Mais on peut trouver pire ! Et la Suisse est un bon exemple, avec le nombre cumulé de décès. Les bases JHU, corona-data.ch donnent le nombre de 1968 au 14 juillet, tandis que sur celle de l'OFSP, c'est 1680... pour le même jour ! 288 décès mystérieusement disparus. Une hypothèse (non vérifiée) proposée par Thibault est que les morts remontaient au départ par canton, ce qui peut expliquer les doublons (habitant d'un canton mort dans un autre). Dans tous les cas, le plus important pour les simulations est que la méthodologie de comptage ne change pas en cours de route. Sinon, la base est corrompue en quelque sorte, et peut devenir inexploitable. Bref, tout cela pour dire qu'il faut toujours regarder avec une infinie précaution les données avant d'en tirer des déductions hâtives, car on peut prendre facilement des vessies pour des lanternes. De ce point de vue, tout cela conforte mon approche d'avoir utilisé les décès comme proxy de l'épidémie (un mort est un mort, pas besoin de mille définitions !) et non les cas certifiés d'infection, qui ont fait l'objet d'une politique parfois à géométrie variable pour un même pays. Je tiens à remercier Thibault pour ses infos et analyses, ainsi que les échanges ouverts avec lui !

- (18 juillet 2020) Le gouvernement catalan appelle les Barcelonais à "rester chez eux". Lire l'article ici.

- (18 juillet 2020) Coronavirus en France: 51 nouveaux clusters en une semaine, 386 au total. Lire l'article ici.

- (18 juillet 2020) Les signaux faibles d'une reprise épidémique en Ile-de-France. Lire l'article ici.

- (18 juillet 2020) L'épidémie semble atteindre un plateau au Brésil. C'était prévu par le code depuis plus d'un mois, mais ce plateau va être long et haut. Actuellement, on est autour de 1300 décès par jour. Peut-on y voir une raison d'être optimiste ? Pour moi pas vraiment, car les racines du processus épidémique dans ce pays sont le laisser-aller. Donc c'est l'évolution naturelle qui prévaut avec au moins 200,000 décès à la clé en fin de course. Lire l'article ici.

- (18 juillet 2020) La reprise de l'épidémie est très nette un peu partout dans le monde. En Chine, nouvelle hausse des cas de contaminations, qui restent en Corée du Sud à un niveau qu'ils n'arrivent pas à faire baisser depuis six semaines au moins. En Suisse, le nombre de personnes en soins intensifs repart à la hausse nettement, prélude à de nouveaux décès. Et ainsi de suite. La France n'est pas prémunie. On constate que malgré l'été, les chaleurs et la sécheresse de l'air, le virus peut circuler très activement. La théorie de la saisonnalité a fait long feu. La contagiosité élévée du virus est sa force. Seul les gestes barrière sont les vrais barrage à sa propagation, en attendant un hypothétique vaccin ou cocktail de médicaments.

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- (19 juillet 2020) Depuis quelques semaines, des signaux faibles au début, et de moins en moins progressivement ont émergé, faisant craindre l'arrivée d'une seconde vague. Le premier pays à ouvrir le bal fut l'Iran, avec une reprise spectaculaire des cas de contaminations, suivie environ trente jours plus tard de la reprise marquée des décès. Avec l'adjonction récente des état du Sud américains, l'Arizona, la Floride notamment, on a assité à un cas d'école de la reprise très forte des contaminations. Une fois de plus, après trente jours environ, les décès sont repartis eux aussi à la hausse. Partout en Europe, des signes encore faibles mais notables d'une circulation accrue du virus sont visibles, comme en France, avec un arrêt de la baisse des décès qui suivait une loi dont les paramètres sont restés inchangés pendant trois mois ou presque, et une croissance forte des cas de contamination en Suisse, alors que le pays avait géré de façon exemplaire l'épidémie jusque là. Les cas en soins intensifs remontent nettement. Dans ce contexte, j'ai décidé de décrire cette vague qui approche (et qui est arrivée en Iran selon la définition que celle-ci est avérée lorsque la courbe des décès présente un minimum, celle-ci servant de proxy pour l'épidémie, comme je l'ai expliqué quelques jours plus tôt). Je vais donc temporairement stopper certaines simulations, pour intégrer cette nouveauté qui avait été prévue dans le modèle, et je donne quelques exemples ci-dessous de nouvelles simulations. Il reste pas mal de travail à faire dans les prochains jours. Avec la prise en compte de cette nouvelle situation, on revient un peu en arrière pour la capacité de prédiction, tant qu'on n'aura pas passé le second pic épidémique. Les chiffres pourront donc paraître élevés pour l'instant, et c'est normal, car l'avenir est de nouveau inconnu. Le point le plus intéressant actuellement est que cette seconde vague a permis de caler bien mieux le point zéro de l'épidémie, sachant que le temps de létalité qui est observé, au sens statistique du terme est de 30 jours. Pour guérir, je prends toujours une douzaine de jours. Avec ce chiffre qui était mal connu auparavant, on se rend compte qu'avec une létalité moyenne de 0.7% déduite des épidémies dans les paquebots, celle-ci a démarré vers le 7 décembre en Chine notamment, ce ui cohérent avec diverses études. On constate ainsi que le puzzle de la COVID-19 est peu à peu résolu avec cohérence, ce qui est satisfaisant. Bien évidemment, le R0 remonte, parfois fortement, et tourne en moyenne autour de 1. Il est plus bas pour la France que certaines régions, mais c'est normal, puisque je fais une moyenne globale. Pour une cohérence générale, tous les pays seront désormais analysés avec la même létalité de 0.7%.

- (19 juillet 2020) Une belle démonstration de l'efficacité des masques pour limiter la propagation du virus. Lire l'article ici.

- (19 juillet 2020) La longue liste des soucis de santé, une fois "guéri" de la COVID-19. Hélas, les problèmes sérieux semblent perdurer. Lire l'article ici.

- (19 juillet 2020) La situation épidémque en Auvergne et Rhône-Alpes. Lire l'article ici.

- (19 juillet 2020) La situation épidémique à Lyon. Lire l'article ici.

- (19 juillet 2020) Des comportements pas très sérieux... Lire l'article ici.

- (19 juillet 2020) La situation à Sao Paulo au Brésil, qui représente un tiers des cas de ce pays, vu la densité et la taille exceptionnelle de la ville. C'tait prévu que dans ce cas la situation soit grave. Elle l'est... On constate bien la périodicité de la délivrance des informations, que l'on retrouve dans les fonctions de corrélation croisée. Merci pour les données !

- (19 juillet 2020) Les masques et les geste de distanciation ne suffisront pas. Il faut protéger les plus vulnérables. Le cri d'alerte des jeunes médecins. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

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- (21 juillet 2020) Taux de reproduction de l'épidémie : 9 régions sont repassées au-dessus de 1. Lire l'article ici.

- (21 juillet 2020) Un médicament réduirait de 79% le risque de développer une forme sévère du Covid-19. Lire l'article ici.

- (21 juillet 2020) Réponse immunitaire cellulaire spécifique contre le coronavirus SARS-CoV-2 : des résultats encourageants, d’autres intrigants. Un article particulièrement intéressant. Lire l'article ici.

- (21 juillet 2020) Deux projets de vaccins "produisent une réponse immunitaire. Lire l'article ici et ici.

- (21 juillet 2020) Qui sont les Français réfractaires au port du masque obligatoire? Lire l'article ici.

- (21 juillet 2020) Les chiffres de la COVID-19 en France suscite de l'inquiétude. Lire l'article ici.

- (21 juillet 2020) L'OMS inquiète de la diffusion du coronavirus en Afrique, alors qu'il n'y a que 15000 décès en six mois pourtout le continent qui ne pratique que peu les gestes barrières. L'Afrique est peu sensible à la COVID-19 grâce à sa pyramide des âges. Les gens seront contaminés, mais peu seront très malades. A noter que dans l'article, l'OMS évoque l'Océanie qui est encore moins touchée ! Exactement la courbe que j'ai calculée (voir analyse statistiques). Là encore, pyramide des âges. Lire l'article ici.

- (21 juillet 2020) A Marseille, les files d'attente s'allongent pour se faire dépister. Mais les cas de contamination augemntent nettement. Se faire tester c'est bien, suite les recommandations, c'est mieux ! Lire l'article ici.

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- (22 juillet 2020) Données instructives sur la mortalité en réanimation. Les chiffres annoncés sont voisins ceux que je trouve pour la France notamment. Lire l'article ici.

- (22 juillet 2020) Le président du conseil scientifique craint une deuxième vague à l'automne. Lire l'article ici.

- (22 juillet 2020) Si un vaccin contre la COVID-19 est disponible en 2021, cela relèvera de l'exploit. Lire l'article ici.

- (22 juillet 2020) De premiers signes « encourageants » après le dépistage de 8.700 personnes en Mayenne. Lire l'article ici.

- (22 juillet 2020) Coronavirus : La Chine exige un test négatif pour toute nouvelle arrivée sur son territoire. Ils ont raison ! Lire l'article ici.

- (22 juillet 2020) De plus en plus de clusters identifiés ces derniers jours dans la région Nouvelle-Aquitaine. Lire l'article ici.

- (22 juillet 2020) Un déficit immunologique expliquerai les cas graves de COVID-19. Lire l'article ici.

- (22 juillet 2020) Le nombre de personnes ayant été infectées serait bien plus important que prévu aux Etats-Unis. cela rejoint les chiffres donnés par les calculs. Lire l'article ici.

- (22 juillet 2020) Les cas d'infection remontent très fortement aux Pays-Bas. Peut-être la remontée la plus forte observée jusqu'à présent par i les pays étudiés. La situation se dégrade aussi dans de nombreux pays, et 30 jours après le virage dans la dynamique épidémique sur le nombre journalier d'infection, on constate la reprise des décès et du nombre de personnes en soins intensifs. La pente est moins forte qu'en février-mars, mais elle est notable d'un relachement des précautions qui s'est généralisé. A suivre donc.

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- (23 juillet 2020) La situation sanitaire en France. Lire l'article ici.

- (23 juillet 2020) Une série de deux articles remarquables sur l'épidémie et la situation générale à paryir d'une analyse ojective des calculs. Les résultats présentés ici sont totalement en accord. Lire les articles ici et ici.

- (23 juillet 2020) Une nouveau symptome de la COVID-19... pas gai... Lire l'article ici.

- (23 juillet 2020) Le coronavirus dans l'air expiré est sans doute infectieux, selon des chercheurs. Lire l'article ici.

- (23 juillet 2020) Les élites russes auraient déjà été vaccinées ! Lire l'article ici.

- (23 juillet 2020) Comment Paris traque le SARS-CoV-2 dans les eaux usées. Lire l'article ici.

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- (24 juillet 2020) Des changements sur le site sont à venir dès aujourd'hui pour les simulations. Après avoir incorporé de manière systématique de chainage des fonctions de distancation afin de décrire les multiples redémarrages de l'épidémie un peu partout dans le monde, les courbes ont reçu de nombreux lifting. Cela permet d'avoir sur chaque courbe les infos les plus importantes et pertinentes. Par ailleurs, les évolutions simulées des quantitiés au cours du temps vont être reprises avec ce changement, et il faudra compter une semaine avant de les avoir disponibles. Ces dernières ne seront désormais mises à jour que toutes les semaines, car la situation devient assez changeante, et on ne peut anticiper le futur !

- (24 juillet 2020) Coronavirus: plus de 1000 nouveaux cas détectés en 24 heures en France. Lire l'article ici.

- (24 juillet 2020) États-Unis: 4 millions de Covid-19 recensés, mais l'épidémie faiblit dans certains foyers. Lire l'article ici.

- (24 juillet 2020) Covid-19: pourquoi il ne faut pas miser sur une saisonnalité du virus. Lire l'article ici.

- (24 juillet 2020) 25 millions de personnes auraient été contaminées par le SARS-CoV-2 selon le premier ministre Rohani... Je ne sais pas d'où il tire ces chiffres, mais c'est n'importe quoi ! On tourne autour de 3.5 millions d'infections estimées pour dix fois moins mesurées. Lire l'article ici.

- (24 juillet 2020) Deux publications techniques sur le SARS-CoV-2 : l'une comme ce dernier pirate le système immunitaire inné et la seconde pourquoi les personnes qui ont un problème de réponse immunitaire développent des formes grave :. Lire les articles ici et ici. Merci pour les liens !

- (24 juillet 2020) Et si Trump obligeait tout le monde à porter des masques? Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (24 juillet 2020) Suite de l'analyse faite par France-Soir sur un possible effet de l'hydroxychloroquine et de l'azythomycine. Les premiers calculs avaient concerné la Suisse avec une faiblesse marquée de la base de données. La nouvelle étude a été étendue à de très nombreux pays, et 53 d'entre eux présenteraient une anomalie 15 j après l'arrêt recommandé de ce traitement par l'OMS. La méthode est correcte, mais les bases de données, lorsque le nouveau de décès est très bas, ne sont pas très précises... De plus, le critère nrCFR est naturellement entaché d'une incertitude élevé. Dans ce contexte, les résultats annoncés me laisse perplexe. Lire l'article ici.

- (24 juillet 2020) . Lire l'article ici.

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- (25 juillet 2020) Les fumeurs finalement plus à risque de contracter une forme grave de la maladie. Lire l'article ici.

- (25 juillet 2020) La question de l'immunité face au virus SARS-CoV-2. Lire l'article ici.

- (25 juillet 2020) La liste des symptômes de la COVID-19. Bon à savoir ! Lire l'article ici.

- (25 juillet 2020) Saisonnalité de la transmission du SARS-CoV-2. Lire l'article ici.

- (25 juillet 2020) La situation devient inquiétante au Liban où l'épidémie repart vite et les décès commencent à monter.

- (25 juillet 2020) La Corée du Sud a du mal à se dépétrer avec sa méthode "miracle". Depuis des semaines, elle traine entre 50 et 70 cas par jour, et là elle vient de franchir les 100 cas d'infection par jour. Lire l'article ici.

- (25 juillet 2020) L'épidémie reprend de l'ampleur au Japon, et le pays se ferme comme une huitre... Lire l'article ici.

- (25 juillet 2020) . Lire l'article ici.

- (25 juillet 2020) Les sympômes de la COVID-19 qui trainent en longueur. Cette maladie est vraiment une saleté. Lire l'article ici.

- (25 juillet 2020) La carte de France des régions à risque... Elle s'allume en rouge presque de partout désormais. Mi-août, si rien n'évolue favorablement, la situation va se compliquer. Lire l'article ici.

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- (26 juillet 2020) Le plan du gouvernement si une seconde vague arrivait en France. Lire l'article ici.

- (26 juillet 2020) La visière portée seule est-elle efficace pour se protéger du SARS-CoV-2 ? Lire l'article ici.

- (26 juillet 2020) Pour les français, le risque de reconfinement est très élevé. Lire l'article ici.

- (26 juillet 2020) Il y a six type de COVID-19. Lire l'article ici.

- (26 juillet 2020)
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- (27 juillet 2020) Suite à un travail approfondi sur la dynamique de la COVID-19 concernant le paquebot de croisière Diamond-Princess, les calculs sont momentanément suspendus. La bonne nouvelle est que le CFR moyen (taux de létalité) obtenu à partir de la dynamique temporelle des décès et des infections sur le Diamond-Princess a pu être rattachée avec précision à un travail de Russell et al. publié le 26 mars 2020, Euro Surveill. 2020;25(12):pii=2000256. De cette analyse, il est très probable que le résultat dans ce papier surestime le CFR d'un facteur proche de 3, mais il donne avec précision la dépendence relative avec l'âge de la létalité ce qui est essentiel. Grâce aux résultats à partir de la pyramide des âges sur le bateau (qu'il a fallu aussi reconstituer), il a été possible de calculer le CFR moyen pour chaque pays dans le monde. Cela change quelques chiffres, notamment le niveau d'immunité collective qui est environ deux fois plus élevés que celui calculé auparavant, mais reste très loin de l'immunité de groupe (1-1/R0). Ce travail était indispensable et avait été mené partiellement début mars, à une époque où beaucoup de données manquaient. On était dependant très proche des bons paramètres, ce qui est rassurant. Mais les calculs menés permettent désormais de bien comprendre certains résultats, notamment, les écarts très importants de l'immunité collective entre certaines villes et les pays. Le virus SARS-CoV-2 dévoile peu à peu ses secrets !

- (27 juillet 2020) La perte de l'odorat avec la COVID-19 expliquée. Lire l'article ici.

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- (28 juillet 2020) Coronavirus: un vaccin américain donne des résultats prometteurs chez les singes. Lire l'article ici.

- (28 juillet 2020) Coronavirus en Mayenne: près de 1000 cas et de nouveaux clusters identifiés. Lire l'article ici.

- (28 juillet 2020) Les Pr. Raoult et Peronne sont-ils médecins ou professeurs des universités ? Question juridique délicate sur la libre expression. Lire l'article ici.

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- (29 juillet 2020) Alors que j'ai approfondi ces derniers jours le cas du Diamond-Princess (voir actu 27 juillet), cet article tombe à point. Lire celui-ci ici.

- (29 juillet 2020) Un vaccin contre la COVID-19 aura forcément des effets secondaires. Il vaut mieux être prévenu pour faire la balance entre les avantages et inconvénients. Lire l'article ici.

- (29 juillet 2020) Les fondemenents moléculaires des formes graves de la COVID-19. Article scientifique très sérieux qui montre l'importance du système de défense immunitaire inné, et du rôle d'un récepteur précis TLR7 pour faire la première barrière au virus. Les chercheurs se sont intéressés aux cas graves de jeunes personnes dont le frère avait aussi une forme très grave de la maladie. Les origines génétiques sont très claires. Heureusement ces mutations génétiques sont très rares, mais elles portent des indices précieux sur les approches thérapeutiques. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (29 juillet 2020) Un modèle SEIR de reconstruction de la dynamique épidémique à Wuhan. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (29 juillet 2020) L'Allemagne commence à s'inquiéter d'un regain des contaminations. Cela fait plusieurs semaines que l'on observait cette tendance qui a même été modélisée (voir ci-dessous). Le nombre journalier de décès ne devrait plus descendre mais lentement repartir à la hausse. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

- (29 juillet 2020) 57% de la population des bidonvilles a été en contact avec le virus ! Mesures statistiques ! Les bidonvilles de Bombay ont donc atteint l'immunité collective selon mes calculs, comme sur les bateaux ou à Bergame. Fantastique résultat qui confirme totalement mon approche à partir de l'analyse du Diamond-Princess. Et le mieux est que les autorités sont surprises par le faible nombre de décès : le taux de létalité en Inde étant bas (0.14%) avec la pyramide des âges, ce n'est pas une surprise ! Elle est même peut-être encore plus basse que cela dans les bidonvilles, vu la jeunesse de la population. Un rapide calcul qui a du sens maintenant que l'immunité collective est atteinte : 20,000,000 (habitant Bombay) x 0.4 (fraction bidonville) x 0.0014 (CFR de l'Inde) x 0.58 (immunité collective) = 6,384 décès calculés pour 6,000 annoncés. Le CFR (taux de létalité) de la COVID-19 est bas (0.33% en France) et c'est la pyramide des âges qui veut cela. C'est pour cela qu'en Afrique, il y a très peu de décès, contrairement aux craintes de l'OMS. La bonne nouvelle est que l'épidémie va s'éteindre à Bombay, toute seule ! En France, le nombre maximum de décès que l'on peut attendre est 70,000,000*0.58*0.0033 = 131,670 décès. On est déjà à plus de 30,000, ce qui veut dire que 25% de la population a vu le virus. Comme ce sont les villes à forte densité qui sont concernées, au jour d'aujourd'hui, c'est cet ordre de grandeur que l'on doit retrouver par des tests sérologiques dans les régions les plus touchées. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

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- (30 juillet 2020) Avec les dernières estimations du taux de létalité (CFR) en fonction de la pyramide des âges, les calculs donnent que l'épidémie s'éteint à Fortaleza parce que l'immunité collective est presque atteinte. Selon les calculs, elle est atteinte lorsque le nombre de décès est de 2700, et ce nombre est dépassé (3600 décès). Mais ce qui est frappant est que le nombre de personnes décédées stagne à des valeurs très faibles, bien que le confinement n'ait pas été correctement suivi. Donc cela conforte l'analyse que le CFR est bas (0.19% pour le Brésil), et c'est une bonne nouvelle pour Fortaleza, qui n'aura pas de seconde vague. La vie va pouvoir reprendre. Evidemment, il reste un réservoir important de gens susceptibles aux alentours, car faible densité de population, mais les chances que cela flambe sont très faible.

- (30 juillet 2020) Le Brésil et les Etats-Unis franchissent des caps macabres. Lire l'article ici.

- (30 juillet 2020) La Chine face à une nouvelle recrudescence de cas d'infection. Lire l'article ici.

- (30 juillet 2020) Hypoxie silencieuse : quand le coronavirus appauvrit l'organisme en oxygène. Lire l'article ici. Merci pour le lien !

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- (31 juillet 2020)

- (31 juillet 2020) Covid-19: Santé Publique France alerte sur la hausse des principaux indicateurs en France. Lire l'article ici.

- (31 juillet 2020) La moitié des patients sous assistance respiratoire sont décédés en Allemagne. C'est un chiffre tragique mais qu'on retrouve. Lire l'article ici.

- (31 juillet 2020) L'immunité pré-existente ! Le serpent de mer. La moitié de la population la posséerait.En tout cas pas dans cette proportion à Fortaleza... et dans d'autres villes comme Bergame ou Bombay. Lire l'article ici ou ici. Merci pour ce dernier !

- (31 juillet 2020) . Lire l'article ici.

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