Les news de la COVID-19... (Janvier 2022)
- Nouvelles du 1er Janvier 2022
- (1er Janvier 2022) L'année 2021 vient de tirer sa révérence, et 2022 démarre en fanfare ! Que de bonnes nouvelles : on a battu le record du nombre de tests positifs quotidiens (Omicron + Delta + augmentation du nombre de tests au moment des fêtes + hiver + baisse immunité vaccinale), tandis qu'Agnès Buzyn et le Comité Scientifique de la COVID viennent de remporter la Légion d'Honneur... J'avoue que la coïncidence entre changement d'année, contaminations et décorations est croquignolesque ! Quand on site Marc Bloch dans une allocution le 31 au soir, reprenant le corps de son livre l'Etrange défaite, et que l'on observe cela, on se dit que les petites médiocrités de la France ont la vie dure. En France, on n'a pas peur du ridicule et depuis longtemps. Le drame, c'est que le ridicule tue parfois plus qu'on ne le croit. J'ai encore en mémoire les conseils loufoques de l'état début mars 2020, les silences assourdissants des spécialistes à cette époque, les innombrables âneries racontées en boucle sur les plateau télé.... Pour moi, la légion d'honneur, elle est pour les soignants anonymes des hôpitaux, des EHPAD,... de tous niveaux, qui se sont engagés à protéger dans le dévouement les malades, rassurer les familles, souvent bien au-delà de leur temps de travail. Eux méritent la reconnaissance du pays et pas seulement un chèque de 100 euros par mois pour les heures supplémentaires ! Comme ces familles de français qui ont hébergé les personnes persécutées pendant la guerre, et ont sauvé des vies au péril de la leur. Toutes ces personnes courageuse ont donné un espérance en l'Homme, et c'est cela le symbole ! Et c'est cela pour moi ce que représente la légion d'honneur ! Je suis bien placé ici pour affirmer que calculer pour des épidémies est certes louable, mais ne relève pas de la légion d'honneur. Au mieux du mérite. Ne voulant pas finir ce billet sur une note triste, je souhaite à toutes et à tous une excellente nouvelle année !
- (1er Janvier 2022) 232200 tests positifs en France, la veille du réveillon. Lire l'article ici.
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- (2 Janvier 2022) Coronavirus : Le pic épidémique « devrait culminer mi-janvier », selon l’épidémiologiste Arnaud Fontanet. Probabble quand on suit l'évolution en Afrique du Sud, d'où semble parti Omicron. Lire l'article ici.
- (2 Janvier 2022) Covid : près de 220.000 nouveaux cas en 24h, les hospitalisations en hausse en France. Lire l'article ici.
- (2 Janvier 2022) Qu'est-ce que le "vaccin muqueux", ce sérum nasal qui pourrait être plus efficace pour lutter contre le Covid ? Très prometteur ! Lire l'article ici.
- (2 Janvier 2022) Les symptômes du covid-19 à surveiller. Revue très utile ! Lire l'article ici. Merci pour le lien !
- (2 Janvier 2022) Ce que vous devez savoir sur les variants du coronavirus. Il n'y a pas qu'Omicron ! Lire l'article ici. Merci pour le lien !
- (2 Janvier 2022) Suivi des cas de covid-19, des décès et des vaccins dans le monde. Lire l'article ici. Merci pour le lien !
- (2 Janvier 2022) Une vidéo sympa sur la COVID-19. Lire l'article ici. Merci pour le lien !
- (2 Janvier 2022) Une analyse au vitriol du CDC à Atlanta.... Lire l'article ici. Merci pour le lien !
- (2 Janvier 2022) Opinion : les Américains devraient apprendre à "vivre" avec le covid-19. Les non vaccinés rendent cela impossible. Lire l'article ici. Merci pour le lien !
- (2 Janvier 2022) Des études suggèrent pourquoi Omicron est moins sévère : il épargne les poumons. Lire l'article ici. Merci pour le lien !
Merci pour le graphique !
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- (2 Janvier 2022) Nouvelles simulations en cours. Le cas de la France est donné ci-dessous. On observe bien le plateau de tests quotidiens positifs pendant quelques jours, marquant le début de la décroissance du variant Delta, avec l'immunité collective théorique atteinte. Elle induit un maximum sur le nombre de personnes en soins intensifs et le nombre prédit par le code sans avoir changé aucun paramètre depuis plus de 15 jours est très proche de celui observé (environ 3500 personnes max). Evidemment, comme rien n'a été changé, le modèle ne décrit pas la dynamique associée à Omicron. On voit bien le changeent d'inflexion, phénomène que l'on retrouve dans de nombreux pays touchés par ce variant. Ce sera ontré lorsque les simulations complètes seront publiées. Fait remarquable: aucun signe d'Omicron dans la dynamique covid pour l'Allemagne, la Suède, la Pologne, les Pays-Bas et la Suisse. L'épidémie est en reflux dans ces pays. Aucun signe également au Brésil (et à Manaus), en Iran, en Russie ! L'immunité collective a-t-elle barré le variant Omicron ? Ce serait étrange, car il semble que le variant puisse se développer sur des populations déjà largement vaccinées et donc a priori immunisées. Mais est-ce le cas pour les personnes déjà infectées ? Cela relance le débat vaccination/infection. Mais cela reste à confirmer, car l'absence d'explosion épidémique liée à Omicron dans certains pays d'Europe voisins les uns des autres interpelle. Reste aussi la question de la dangerosité supposée moindre du variant Omicron. Pour l'instant, aucune évidence claire. Il faut être prudent, car au Royaume-Uni qui fut un des premiers pays touchés par Omicron, l'augmentation des cas graves de covid associés à ce variant ne devrait pas arriver avant une petite semaine si la règle des 20 jours de délai par rapport à la série des tests quotidiens positifs est toujours de mise. Donc, on est en plein dans l'inconnu, avec beaucoup de disparités.
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- (3 Janvier 2022) Covid-19 : le gouvernement "prend un gros risque" en laissant circuler le virus, prévient Eric Caumes. Lire l'article ici.
- (3 Janvier 2022) Israël: feu vert pour la quatrième dose de vaccin anticovid pour les plus de 60 ans et les soignants. Lire l'article ici.
- (3 Janvier 2022) Plus contagieux mais moins grave que delta: la nature du variant Omicron se précise. Lire l'article ici.
- (3 Janvier 2022) Variant Omicron : "On n'est plus dans la même épidémie", assure Martin Blachier. Lire l'article ici.
- (3 Janvier 2022) Covid-19: pour le Pr Grimaldi, les non vaccinés devraient pouvoir dire s'ils souhaitent ou non être réanimés... Très polémique et surtout, pas certain que cela soit très déontologique... Lire l'article ici.
- (3 Janvier 2022) L'ensemble des simulations viennent d'être mises à jour, et la COVID-19 n'a pas fini de nous apporter des surprises malgré les vaccinations et la proximité de la plupart des pays de l'immunité collective théorique. Chose assez incroyable, il y a de nombreux pays qui ne sont pas concernés par le variant Omicron dont on parle tant depuis un mois, et qui semble selon les médias ravager la planète ! Et bien c'est totalement FAUX ! Il y a de nombreux pays pays dont la dynamique épidémique reste encore dominée par le variant Delta à la baisse par imunité collective. Certains, comme je l'écrivais hier sont toujours dans une dynamique décroissante, comme le Brésil, l'Iran et même la Russie. A ces pays on peut ajouter la Corée du Sud, la Pologne, la Belgique et même la Suisse ! Nos pays voisins ! Pour les Pays-Bas, on constate une reprise récente liée certainement à Omicron, sachant que le pays est sous le coup d'un confinement, qui ne semble pas efficace contre ce dernier d'ailleurs... alors pourquoi des pays voisins voient leur épidémies baisser et même fortement, sans que le variant Omicron n'apparaisse ? Mystère, car ce variant, quand il apparait est vraiment très contagieux. Le R(t) calculé à partir des cas quotidiens positifs atteint 2.4, ce qui est considérable, si l'on considère que les paramètres de simulation sont inchangés. Et justement, dans les simulations, je n'ai rien changé dans les paramètres du code. Volontairement, pour voir en contraste s'il est effectivement moins dangereux, si le retard entre cas et soins intensifs et décès a changé. De toute évidence, le variant Omicron est ré-infectant, car la plupar des pays concernés ont atteints l'immunité collective théorique (pour tous les autres variants, Delta compris), donc, le phénomène Omicron est une épidémie dans l'épidémie comme à Manaus au Brésil voici un an (voir les simulations toujours en ligne). Le réservoir des susceptibles est donc quasi-vierge, ce qui explique largement la force de la reprise épidémique. Les simulations effectuées ici avec Omicron ne sont donc maintenues que pour la comparaison Omicron/Delta, mais elles perdront leur sens rapidement et elles seront arrêtées, comme celles de Manaus. Elles pourront être poursuivies pour les pays dominés par le variant Delta. Les pays ayant eu une très forte proportion d'infectés et proche de l'immunité collective semblent épargnés par la vague Omicron, mais pas ceux qui sont loin de l'immunité collective théorique. Le cas du Sénégal est assez remarquable de ce point de vue. Depuis un mois l'épidémie explose, après avoir presque disparu. C'est certainement Omicron, car pour tous les pays concernés, le taux d'infection par jour est le même, quel que soit le continent (fascinant) : 0.2 ce qui donne le même R(t) de 2.4. Israel qui a toujours une longueur d'avance dans la lutte contre la COVID-19 subit de plein fouet l'explosion des cas liés à Omicron, et l'on voit pour la première fois l'inflexion sur les cas en soins intensifs, en très bon accord avec le code. Il faudra suivre cela avec attention. La vague Omicron n'a pas duré en Afrique du Sud, et on peut s'attendre à une situation analogue ailleurs. Mais rien ne le prouve. Comme également que ce serait la dernière vague. En effet,avec un nombre d'infections démultipliés, il est poosible que d'autres variants émergent, aussi contagieux, avec un nouvel échappement immunitaire. Rien ne permet vraiment d'affirmer le contraire aujourd'hui. L'épidémie de COVID-19 a été d'une remarquable constance durant presque deux ans, et le modèle simple développé ici a permet de bien souligner cela, et aussi de casser certains mythes sur les traitements. Si l'espérance reste de mise, la prudence doit prévaloir plus que jamais.
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- (4 Janvier 2022) Variant Omicron : vers la fin de l'épidémie en France, l'immunité collective en trois points. Lire l'article ici.
- (4 Janvier 2022) Coronavirus à Lyon : « Nous avons, pour l’instant, uniquement des cas Delta en réanimation ». Très cohérent avec l'analyse des données (voir news du 2 janvier 2022) Lire l'article ici.
- (4 Janvier 2022) Coronavirus en Israël : Un cas de double infection au Covid-19 et à la grippe, baptisé « Flurona », détecté. Lire l'article ici.
- (4 Janvier 2022) Deux ans après le début de la pandémie, voici ce que l'on sait sur les origines du Covid-19. Lire l'article ici.
- (4 Janvier 2022) "Ils se croyaient immunisés": Pierre-Jean Chalençon raconte les dernières semaines des frères Bogdanoff. Lire l'article ici.
- (4 Janvier 2022) Igor Bogdanoff est décédé des suites du Covid-19 ce lundi, six jours après son frère jumeau Grichka. Lire l'article ici.
- (4 Janvier 2022) Martin Blachier : "La vague Omicron est un phénomène fabriqué". Il faut lire les séries temporelles dans de nombreux pays !! Lire l'article ici.
- (4 Janvier 2022) Covid - La mystérieuse origine d'Omicron révélée : le variant a fait un saut de l'homme à la souris en 2020. Lire l'article ici.
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- (5 Janvier 2022) COVID-19: Nouveau record en france avec 271.686 contaminations en 24h. Lire l'article ici.
- (5 Janvier 2022) Covid-19: 64 enfants actuellement en réanimation pédiatrique, selon Olivier Véran. Lire l'article ici.
- (5 Janvier 2022) Présidentielle 2022 : Emmanuel Macron fait part de son envie d'être candidat et se dit décidé à « emmerder » les non-vaccinés. Lire l'article ici.
- (5 Janvier 2022) Malgré la vaccination des pensionnaires, Omicron fait-il vaciller les Ehpad ? Lire l'article ici.
- (5 Janvier 2022) Pourquoi la prédominance du variant Omicron ne marque pas forcément la fin de l'épidémie. Lire l'article ici.
- (5 Janvier 2022) cette nouvelle étude permet de déterminer que le variant Omicron s'attaque moins aux poumons que le Delta ou la souche d'origine du coronavirus. Lire l'article ici.
- (5 Janvier 2022) "Il a largement raison": un mois avant leur mort, les frères Bogdanoff citaient Didier Raoult pour justifier leur non vaccination. Lire l'article ici.
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- (6 Janvier 2022) Tom Wenseleers, biostatisticien: "Omicron peut infecter 40 à 50 % de la population" en Belgique. Lire l'article ici.
- (6 Janvier 2022) Face à Omicron, les anticorps monoclonaux (presque) tous mis hors jeu. Lire l'article ici.
- (6 Janvier 2022) «Il faut arrêter de se focaliser sur les contaminations», insiste une épidémiologiste. Lire l'article ici.
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- (7 Janvier 2022) Pourquoi l'immunité collective ne fera pas disparaître Omicron. Lire l'article ici.
- (7 Janvier 2022) Nouveau variant : les spécialistes taclent Didier Raoult. Lire l'article ici.
- (7 Janvier 2022) Cartes SIM bloquées, permis retirés : ces sanctions folles contre les non-vaccinés dans le monde. Lire l'article ici.
- (7 Janvier 2022) Pendant ce temps, AstraZeneca vaccine le reste du monde contre le Covid-19. Lire l'article ici.
- (7 Janvier 2022) "N'infligez pas ça à vos proches": la veuve d'un non-vacciné mort du Covid-19 lance un appel à la vaccination. Lire l'article ici.
- (7 Janvier 2022) Omicron : les autorités sanitaires françaises retirent trois traitements inefficaces. Lire l'article ici.
- (7 Janvier 2022) Omicron : La paralysie du sommeil, quel est ce symptôme "effrayant" qui frappe au moment de s'endormir et de se réveiller ? Lire l'article ici.
- (7 Janvier 2022) Qu'est-ce que le « flurona » ? Les co-infections au coronavirus et à la grippe signalées sous forme de poussées omicron.. Lire l'article ici. Merci pour le lien !
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- (8 Janvier 2022) Pour l'épidémiologiste Dominique Costagliola, "la vague delta n'est pas du tout terminée". Elle a raison !Lire l'article ici.
- (8 Janvier 2022) Anthroposophie, pyramide cachée... "Novax Djocovid", star du tennis et des pseudosciences. Lire l'article ici. On peut avoir de gros muscles et un petit cerveau...
- (8 Janvier 2022) Des symptômes mais un test négatif ? Les tests PCR détectent Omicron trois jours avant les tests antigéniques. Lire l'article ici.
- (8 Janvier 2022) Pourquoi Omicron pourrait être le dernier variant « préoccupant ». Lire l'article ici.
- (8 Janvier 2022) Passe vaccinal : "Les non-vaccinés seraient totalement exclus des centres commerciaux". Lire l'article ici.
- (8 Janvier 2022) Covid-19: face à la persistance du virus, Israël entend dorénavant vivre avec. Lire l'article ici.
- (8 Janvier 2022) Filmé en réanimation puis cible des complotistes : Karim est réellement mort de la Covid. Lire l'article ici.
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- (9 Janvier 2022) Les non-vaccinés représentent 56% des entrées en soins critiques et 42% des décès. Lire l'article ici.
- (9 Janvier 2022) "On a loupé le coche de la troisième dose" et il faut "réfléchir à la quatrième dose", estime Eric Caumes. Lire l'article ici.
- (9 Janvier 2022) Face à Omicron, qui contamine autant les vaccinés que les non vaccinés, faut-il abandonner le pass sanitaire ? Lire l'article ici.
- (9 Janvier 2022) Ce tableau montre combien l’aération change tout contre Omicron. Lire l'article ici.
- (9 Janvier 2022) Covid-19: un patient non-vacciné témoigne de son combat depuis sept mois contre la maladie. Lire l'article ici.
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- (10 Janvier 2022) Vaccins contre la COVID19 : doiton s'inquiéter du risque de maladie aggravée chez les personnes vaccinées ? Très important ! Lire l'article ici.
- (10 Janvier 2022) Anticorps facilitants et pathogénèse du COVID 19. Lire l'article ici.
- (10 Janvier 2022) Covid-19: le nombre de cas et d'hospitalisations toujours élevé en France. Lire l'article ici.
- (10 Janvier 2022) Les médecins réfractaires à la vaccination anti-Covid, votre coup de gueule 2021. Lire l'article ici.
- (10 Janvier 2022) Trois choses à savoir sur Novavax, le nouveau vaccin qui pourrait arriver en France en février. Lire l'article ici.
- (10 Janvier 2022) Covid-19: plus de 150.000 morts au Royaume-Uni depuis le début de la pandémie. Lire l'article ici.
- (10 Janvier 2022) Benjamin, 39 ans, non-vacciné, a passé 15 jours dans le coma à cause du Covid-19 : "J'ai failli tuer ma femme". Lire l'article ici.
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- (11 Janvier 2022) Presque 500.000 morts du Covid en Inde : un bilan officiel six fois inférieur à la réalité ? Lire l'article ici.
- (11 Janvier 2022) Covid-19 : observe-t-on une "augmentation brutale de la mortalité" dans les pays très vaccinés ? Lire l'article ici.
- (11 Janvier 2022) Coronavirus : Hausse des hospitalisations et des admissions en soins critiques. Lire l'article ici.
- (11 Janvier 2022) Omicron: Arnaud Fontanet prévoit un pic mi-janvier et une "baisse sensible" des infections en février. Lire l'article ici.
- (11 Janvier 2022) Covid-19 : interviewé par "Sept à Huit" à côté de sa femme hospitalisée, un non-vacciné persiste et signe. Lire l'article ici.
- (11 Janvier 2022) Covid-19 : pourquoi des triples vaccinés sont-ils contaminés par le variant Omicron ? Lire l'article ici.
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- (12 Janvier 2022) Les patients de moins de 40 ans sont-ils plus nombreux en réanimation que ceux de plus de 80 ans ?. Lire l'article ici.
- (12 Janvier 2022) Non, un nouveau variant « Deltacron » n'existe pas pour l'instant. Lire l'article ici.
- (12 Janvier 2022) Coronavirus aux Etats-Unis : Record d’hospitalisations, le docteur Fauci accuse un élu républicain « d’exciter les fous ». Lire l'article ici.
- (12 Janvier 2022) Coronavirus : Deux ans après, « le nombre de morts n’intéresse plus personne ». Lire l'article ici.
- (12 Janvier 2022) D'après des données de l'AP-HP, les patients infectés par Omicron "restent très minoritaires en soins critiques". Lire l'article ici.
- (12 Janvier 2022) Omicron va faire sortir le Covid-19 de la phase pandémique, estime l'Agence européenne des médicaments. Lire l'article ici.
- (12 Janvier 2022) Covid-19 : 368.149 nouveaux cas détectés en 24 heures, un nouveau record. Lire l'article ici.
- (12 Janvier 2022) Au Royaume-Uni, les signes du début de la fin de la vague Omicron. Lire l'article ici.
- (12 Janvier 2022) Prédire les moteurs mutationnels des futurs variants préoccupants du SARS-CoV-2. Très intéressant dans les mécanismes en jeu. Lire l'article ici. Merci pour le lien !
- (12 Janvier 2022) La dynamique de l'infectivité du SRAS-CoV-2 avec les changements dans le microenvironnement des aérosols. Lire l'article ici. Merci pour le lien !
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- (13 Janvier 2022) On commence de plus en plus à lire dans les médias que la fin de la pandémie est proche ! Bonne nouvelle, car tout le monde est usé par les contraintes liées à ce petit mais encombrant virus. Ce n'est pas la première fois que des annonces pleines d'espoir ont été douchées par des vagues importantes, et il faut rester prudent. D'abord la vague Omicron va bientôt s'arrêter. Pourquoi ? Parce que le virus étant très contagieux, de nombreuses personnes sont infectées et donc immunisées contre ce variant très différent des précédents, puisqu'il est capable de contourner les défenses immunitaires développées par les vaccins et les infections des précédents variants. Cette évolution rapide a été observée en Afrique du Sud, et au Royaume-Uni, l'épidémie commence également à décliner depuis quelques jours. La grande question est alors : et après ? L'après-Omicron dépend soit de l'émergence d'un nouveau variant (et là personne ne sait rien), ou la persistance du variant Delta qui n'a pas dit son dernier mot. En fait, Omicron et Delta ne procurent pas la même immunité, ce qui fait dire que l'on a observé deux épidémies en parallèle, l'une dangereuse Delta, l'autre bien moins Omicron. Il est peu probable que l'infection par Omicron protège contre Delta, vu les différences moléculaires concernant la fameuse protéine spike. Donc le variant Omicron n'a pas remplacé Delta, mais s'est juxtaposé à Delta. Très grande différence avec le passage de la souche initiale au variant anglais en janvier 2021, puis de l'anlais à l'indien (Delta) en mai 2021 où là c'était bien un remplacement par une contagiosité accrue qui était à l'oeuvre. Il n'est même pas évident qu'Omicron soit bien plus contagieux que Delta, mais son réservoir de personnes susceptibles est beaucoup pus grand que celui de Delta. Cela change tout dans la propagation du virus. Qu'est-ce qui bloque alors Delta ? Les infections passées et les vaccinations !! Et là, le réservoir pour le variant Delta considérablement plus petit, la 3ème dose (booster) ayant fortement renforcé les défenses immunitaires qui baissaient dangereuseent après la deuxième injection. Cette baisse fut la cause principale du retour de l'épidémie à l'automne (avec un encore fort taux de non-vaccinés), amplifiée par les conditions climatiques favorables aux infections dès l'automne. Dans ce contexte, la situation la plus plausible, est une chute prochaine des tests positifs quotidiens liés à Omicron, mais un niveau toujours assez élevé pour les personnes en soins intensifs qui sont d'ailleurs, d'après les professionnels eux-même, la conséquence du variant Delta, même pendant l'épidémie d'Omicron. Maintenir un haut degré d'immunité collective est le seul moyen de contrer le Delta, et certainement de ralentir l'épidémie de COVID-19. Donc, l'épidémie n'est a priori pas terminée, et l'épisode Omicron peut être considéré comme un événèment externe distinct, tandis que la vraie pandémie de COVID-19 (Delta) est toujours à l'oeuvre mais contrée par la vaccination. Il faut donc rester très prudent sur les extrapolations à court et moyen terme. On aimerait tous que cette pandémie se termine, mais ce n'est pas parce qu'on le souhaite que cela arrivera. Gestes barrière et vaccinations restent plus que jamais d'actualité, et les récalcitrants à la vaccination devraient être très prudents, car les risques de formes graves restent très forts pour eux. Des simulations prochaines viendront étayer cette analyse.
- (13 Janvier 2022) Omicron : quels symptômes alertent sur le besoin urgent de soins à l'hôpital ? Lire l'article ici.
- (13 Janvier 2022) La Suisse évoque le « début de la fin » de la pandémie avec le variant Omicron. Lire l'article ici.
- (13 Janvier 2022) Variant Omicron: les scénarios de l'Institut Pasteur pour le pic hospitalier. Lire l'article ici.
- (13 Janvier 2022) Quel impact du variant Omicron sur l'hôpital? L'Institut Pasteur réajuste ses projections. Lire l'article ici.
- (13 Janvier 2022) On en sait plus sur l'origine de "Deltacron", fusion des variants Delta et Omicron. Lire l'article ici.
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- (14 Janvier 2022) Omicron: les problèmes que pose un variant trois fois moins sévère, mais deux fois plus transmissible. Lire l'article ici.
- (14 Janvier 2022) Les pays les plus vaccinés sont-ils ceux qui enregistrent le plus de contaminations, comme l'affirme le Pr Raoult ? Lire l'article ici.
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- (15 Janvier 2022) Cerveau, cœur, poumons, reins… Quelles sont les séquelles d’un Covid léger tel qu’Omicron? Impressionnant si c'est confirmé... Lire l'article ici.
- (15 Janvier 2022) «Ils se sont montrés impolis et rudes» : le mauvais souvenir de Martin Blachier avec les équipes de «Quotidien». Lire l'article ici.
- (15 Janvier 2022) Omicron furtif : quel est ce sous-variant indétectable qui inquiète les scientifiques ? Lire l'article ici.
- (15 Janvier 2022) Vaccination : Entre 500 et 700.000 pass sanitaires possiblement désactivés samedi. Lire l'article ici.
- (15 Janvier 2022) Ce qu'il faut savoir sur Novavax, le nouveau vaccin anti-Covid. Lire l'article ici.
- (15 Janvier 2022) Coronavirus : Le scénario catastrophe s’éloigne des hôpitaux français, selon l’Institut Pasteur. Normal, car seul le variant Delta cause des cas graves. Lire l'article ici.
- (15 Janvier 2022) "Les hospitalisations des enfants augmentent, particulièrement chez les moins d'un an", affirme la directrice générale de Santé publique France. Lire l'article ici.
- (15 Janvier 2022) Après Omicron, le prochain variant sera-t-il forcément moins dangereux? Lire l'article ici.
- (15 Janvier 2022) Le passe vaccinal n'est «ni de la médecine, ni de la santé publique», dénonce Éric Caumes. Lire l'article ici.
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- (16 Janvier 2022) Vaccinés mais positifs au Covid-19, nos lecteurs ne regrettent pas leur troisième dose. Lire l'article ici.
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- (17 Janvier 2022) "Encore en forte progression": la directrice de Santé Publique France met en garde sur la situation épidémique. Lire l'article ici.
- (17 Janvier 2022) Nouvelle vague Omicron en début d'été 2022, selon le conseil scientifique du Royaume-Uni. Approche divinatoire ! Lire l'article ici.
- (17 Janvier 2022) Vaccinés, ils refusent la dose de rappel : "Je n'ai plus confiance, ni en ce vaccin, ni en nos dirigeants". Lire l'article ici.
- (17 Janvier 2022) Coronavirus : Vers « une décrue assez rapide » selon l’épidémiologiste Vittoria Colizza. On est tous d'accord pour Omicron. Ce sera aussi le cas pour le Delta qui ne s'est pas envolé, grâce à la vaccination. La baisse de l'immunité risque de le voir revenir. Lire l'article ici.
- (17 Janvier 2022) Nouvelles simulations de la COVID-19 dans le monde. Grand bouleversement, Omicron n'est volontairement pas considéré dans les calculs, car (i) il s'agit d'une épidémie dans l'épidémie sur le simple critère qu'Omicron peut s'échapper sur le plan immunitaire, et donc ré-infecter des personnes déjà infectées par les précédents variants ou vaccinées (même trois fois), (ii) les risques graves associés à Omicron sont très faibles, et donc, considérer Omicron dans les calculs, c'est un peu comme si on prenait en compte un rhume par coronavirus dans les calculs !! Peut-on faire la distinction entre la dynamique Omicron et Delta ? Oui et ceci grâce à l'absence de gravité des cas d'infections Omicron et aussi des décès. On peut donc identifier le rôle de chaque variant. Paradoxalement, la simulation est plus simple, et les paramètres de simulations pour le variant Delta n'ont que très peu évolué depuis de nombreuses semaines (cinq à six semaines). Ce choix est bien justifié par les observations dans de nombreux pays. Les contaminations ont explosé presque partout (même si la tendance est à la baisse maintenant, comme en Afrique du Sud, l'épidémie Omicron ne sera très probablement qu'un feu de paille). Il restera à la sortie prochaine de celle-ci, mettons mi-février, qu'une seule question à se poser : l'infection par Omicron protège-t-elle contre le Delta ? On sait que l'inverse est faux (puisqu'il y a les ré-infections) mais dans le sens opposé, ce n'est pas clair. Si c'est le cas, cela accélèrera la fin de la pandémie, grâce à la probable contagiosité accrue d'Omicron. En revanche, si ce n'est pas le cas, les contaminations vont retomber au niveau estimé pour le Delta dont la proportion remontera mécaniquement. Dans ce cas de figure, comme l'immunité vaccinale baisse avec le temps, et en tenant compte des récalcitrants à la piqure, il est très probable que l'épidémie reparte. Il est évidemment impossible d'être affirmatif, mais en suivant ce raisonnement, nous aurons une période plus calme pendant quelques mois, avant que cela ne reparte, au cours du printemps. On sait que le virus n'est pas saisonnier en raison de la valeur de R0 très élevée (grande contagiosité), et que la dynamique épidémique dépend des comportements et du caractère susceptible ou non d'une fraction de la population. Donc on bénéficie ouvertement de la vaccination et en particulier de la 3ème dose ! Cela se voit même dans les séries temporelles notamment pour la France. On y reviendra !
A partir de la dynamique des tests quotidiens positifs, on observe maintenant partout ou presque, un retournement de situation, avec une forte montée, qui a débuté vers fin décembre. Elle arrive alors que l'épidémie de Delta est à la baisse de partout, que cela soit par infection ou grâce à la vaccination (booster) et la proximité de l'immunité collective théorique. Comme il y a un délai d'une vingtaine de jours entre la courbe des tests quotidiens positifs et le nombre de personnes en soins intensifs ainsi que le nombre quotidien de décès, on observe bien pour les pays les premiers touchés par Omicron qu'aucune remontée des décès ou du nombre de personnes en soins intensifs n'est clairement visible. Cela viendra peut-être plus tard, mais c'est peu probable compte-tenu des retours des hôpitaux. Donc Omicron s'est bien diffusé universellement, mais au vu des données, la situation sanitaire avec Omicron n'est pas aussi catastrophique que celle de Delta (dans la mesure où les hospitalisations standards restent gérables, ce qui est le cas). On a donc largement sur-évalué le problème Omicron. Une certaine perte de rationnalité a été clairement à l'oeuvre. Ceci-dit, pousser les gens à se faire vacciner est important, car si Omicron n'est pas un problème, Delta le reste encore et on aurait tord de croire qu'il a disparu. Loin de là.
Sur la base des considérations précédentes, la forme grave de l'épidémie est à la baisse. Et tout concorde dans TOUS les pays ou états étudiés. En France notamment, on observe bien la baisse du nombre de personnes en soins intensifs, mais avant cette dynamique récente de reflux, on observait depuis début décembre un net ralentissement qui est la conséquence favorable de la 3ème vaccination qui a été lancée peu avant. Le bénéfice de la 3ème vaccination est donc bien réel. Il est donc utile de se faire vacciner ! Et grâce à cela, on observe le retournement de la tendance épidémique (on ne parle ici que du Delta, plus de Omicron). La tendance est à la saturation sur les décès quotidiens, et la baisse est imminente. Maintenant, sans passer en revue tous les pays étudiés, on retrouve cela clairement. Au Royaume-Uni, le tendance générale est cohérente avec cette immage. A noter un sursaut des décès quotidiens, et celui-ci me semble plus une conséquence du Delta, puisqu'il serait connecté à la période précédant l'arrivée d'Omicron. Sa cause n'est pas claire, d'autant que le nombre de personnes en soins intesifs est lui à la baisse depuis plus de deux mois !! Il faudrait aller dans le détail des causes de décès pour comprendre, ce qui est hors cadre des travaux menés ici. Au Sénégal, l'épidémie est repartie, et les décès arrivent comme attendus par le modèle. Cela semble indiquer, vu les dates et les corrélations qu'il ne s'agit pas d'Omicron, même si cela doit se mélanger maintenant.
Pour la Turquie, la Russie, l'Iran, le Brésil, le Liban et le Mexique, l'épidémie Delta est à la baisse et celle d'Omicron bien visible commence rapidement à décliner. Idem pour l'Inde. L'anomalie sur le fait que le nombre quotidien de tests positifs est à la baisse et que le nombre quotidien de décès ne baissait plus semble, pour être comprise, résulter d'un problème de comptage administratif. Fin octobre, un saut est en effet clairement apparu, un offset qui n'a pas bougé depuis, et mis-à-part celui-ci, la tendance des décès est bien à la baisse comme pour les contaminations avec la même dynamique !
En Europe en général, et même aux Etats-Unis, la vague Omicron est déjà sur le déclin, et on constate bien l'absence de cas graves de la COVID-19, si tant est qu'on puisse parler de l'infection par Omicron comme un COVID-19. Je l'appellerai bien COVID-21 !!
Enfin, concernant Israel, après un plateau de contamination certainement lié à la baisse de l'immunité vaccinale, donc l'éloignement de l'immunité collective théorique (le pays avait fortement ralenti sur la 3ème injection), il a lancé tardivement la 4ème injection pour les personnes de plus de 60 ans, pour contrer cette reprise, malgré leur avance initiale (voir les courbes de vaccination), On constate par ailleurs une très forte reprise du nombre de personnes en soins intensifs (avec un décrochement suspect...), tandis que le nombre quotidien de décès reste très bas. Cela fait penser que la politique d'hospitalisation en soins intensifs aurait pu changer avec Omicron, puisque la pente est très corrélée à celle des cas de contaminations avérés. Le pays verra très certainement un retour à la baisse comme ailleurs. Suivre le nombre quotidien de décès sera une bonne manière de jauger ce qui s'est réellement passé.
Au vu des résultats des simulations, et de la séparation entre la dynamique liée à Omicron et celle conséquence du variant Delta, les prochaines simulations seront effectiuées d'ici un mois environ. En effet, comme indiqué dans la notice pdf téléchargeable, les phases de décroissance épidémiques sont stables et précises pendant de longues durées. On l'a observé à plusieurs reprises après les périodes de confinement. Suivez les données sur Google ou covid-tracker, et comparez !! Evidemment, toute analyse présente une part d'incertitude, et un modèle ne vaut que par les raisonnements qui l'accompagnent. Il n'y a pas de calculs magiques !!! Ici le modèle est intentionnellement très simple, mais très robuste ! Il a ses limites que j'ai discutées de nombreuses fois. La COVID-19 liée au variant Delta va s'estomper, c'est mécanique donc quasi-certain. Mais si les infections par Omicron ne protègent pas contre le Delta, alors se dernier remontera en puissance progressivement, avec la baisse d'immunité et la permanence d'une fraction de la population non vaccinée. Si Delta donne lieu à l'émergence d'un nouveau variant, il aura de plus en plus de mal à se développer face à une population résistante, pour cette branche virale. Mais personne ne peut savoir ce qui va se passer en terme de nouveaux variants. Il y a beaucoup de fantasmes anxiogènes inutiles. Comme depuis le début, l'épidémie de COVID-19 peut être comprise assez facilement. Le message est souvent brouillé par les messages pessimistes infondés, de personnes "spécialistes" qui répètent les propos du voisin. Le colportage est un mal sociétal terrible quand l'information circule très vite comme aujourd'hui.
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